뇌정맥 혈전증(Cerebral venous thrombosis)은 뇌의 혈전은 주로 동맥을 막지만 드물게 혈전이 뇌정맥을 막는 질환으로 뇌의 혈액 저류로 허혈적 손상이나 뇌출혈, 뇌부종 등이 발생할 수 있다.